La actividad del hombre ha influÃdo sobre la fauna autóctona, aún más decisivamente que sobre la flora. Otro factor es la proliferación de especies foráneas, que se han multiplicado al amparo de las excelentes condiciones naturales, o de las modificaciones creadas en el paisaje por la actividad económica.
Las principales especies son:
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MamÃferos
Puma o león americano, gato montés, zorro gris y colorado, conejo de los palos, guanaco, jabalÃ, pecarÃ, comadreja, nutria , vizcacha, liebres, corzuela.
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Aves

Condor
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Buitres, halcón, gavilán, loros, martÃn pescador, palomas, avestruces, perdices, cigüeñas, garzas, patos, flamencos, condor.
Reptiles y batracios, Iguana, lagartija, ofidios, batracios.
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Cabra solitaria
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La especie más conocida y cuyo nombre identifica al parque es el cóndor. La Pampa de Achala es el área de distribución más oriental de esta gigantesca ave carroñera.
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También nidifica aquà el halcón peregrino y se han avistado ejemplares de cóndor real. Pampa de Achala es habitada además por unas 30 especies de mamÃferos no endémicos, entre ellos el puma, el gato montés y el gato pajero.
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Burrito Córdobes
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La yarará ñata es su única vÃbora venenosa. De las numerosas especies de artrópodos se destacan por sus dimensiones los nidos y caminos de la hormiga cortadora colorada.
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Biologos y avistadores de aves de todo el mundo viajan a Pampa de Achala para observar sus endemismos.
Entre los anfibios pueden mencionarse a los sapos de achala y al escuercito de achala.
Entre los reptiles existe un único endemismo, el vistoso lagarto verde de achala.
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Caminera ala colorada
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Once subespecies y una especie de aves son exclusivas de la zona: caminera ala colorada, caminera común, remolinera oscura, remolinera castaña, canastero pálido, canastero manchado serrano, gaucho cola blanca, dormilona cenicienta, pecho colorado grande, piquito de oro grande, frigilio plomizo y oquencho.
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Entre los mamÃferos la subespecie endémica es el “zorro colorado”, poco abundante, y entre los invertebrados el “alacran”.